第一條
澎湖縣政府（以下簡稱本府）為杜絕養豬污染、維護水源海洋、提升居住環境品質、促進澎湖縣（以下簡稱本縣）觀光產業發展，推行本縣養豬全面離牧，特制定本自治條例。
第二條
本縣禁止新設立養豬畜牧場或飼養登記，現登記有案之養豬戶亦不得擴大飼養規模或移轉他人。
第三條
現有養豬戶離牧補償金申請期限至本縣全面離牧止。
辦理離牧所需補償金由本府爭取中央補助經費核後發。
第四條
養豬戶離牧補償金發放標準如下：
一、申請農戶需全場離牧；同一負責人經營之養豬場，在不同地點、不同地號者，得由業者自行選擇離牧。
二、補償對象為最新期「台灣地區養豬頭數調查」具有在養紀錄且至主動申請離牧補償日仍繼續飼養者。
三、補償費用不計算建築結構材質及折舊，各種畜舍及廢水處理設施補償費用如下：
(一)分娩舍及飼料室（分娩舍須有分娩欄、飼料室須設置飼料混合機）每平方公尺一千八百元。
(二)保育舍及母豬舍（保育舍須具有高床設備，母豬舍須有夾欄）每平方公尺一千五百元。
(三)肉豬舍每平方公尺一千二百元。
(四)廢水處理設施（簡易沈澱池處理方式者除外）每立方公尺二千二百五十元。
四、補償上限為：
(一) 畜舍補償面積上限為二千五百平方公尺。
(二) 廢水處理設施補償上限為一百八十萬元。
五、養豬場依取得牧場登記、合法建物證明及土地作畜牧設施容許使用等合法證照，差別補償標準如下：
(一)未辦理土地作畜牧設施容許使用，但具有土地使用權證明，牧場用地需符合土地分區使用管制規則，且畜舍在水源水質水量保護區公告前興建者：以補償費用一倍計算。
(二)未取得合法建物證明，但已取得土地作畜牧設施容許使用者：以補償費用一點二倍計算。
(三)未辦理牧場登記，但已取得合法建物證明者：以補償費用一點四倍計算。
(四)已辦理牧場登記或飼養規模未達登記條件但已取得合法建物證明者：以補償費用一點五倍計算。
六、屋頂不拆除，內部設備全部拆除者，以補償費用二分之一補償。養豬戶並應切結該場土地不得再作養豬場使用。
七、畜舍拆除其廢棄物之清除費每一千平方公尺補償五萬元，上限以二千五百平方公尺計，最高給予清除費十二萬五千元。
第五條
接受離牧補償之養豬場，應切結三年內土地變更為建築用地使用時，繳回所領取之離牧補償金後，始得辦理土地變更使用。但因政府辦理徵收或都市計畫逕為變更者，不在此限。
第六條
現有養豬戶未辦理離牧者，其畜牧場應設置廢污處理設備，並應符合有關法令規定之設置標準。
第七條
養豬戶如有違反前條規定經查獲者，視其情節依廢棄物清理法、水污染防治法及空氣污染防治法等有關法令處罰。
第八條
本自治條例自公布日施行。
本自治條例中華民國一零七年二月九日修正公布之條文，自公布日施行。