1.中華民國八十九年一月二十一日澎湖縣政府澎府秘法字第 00326  號令
  訂定發布
2.中華民國八十九年三月二十九日澎湖縣政府澎府行法字第 12679  號修
  正發布全文 11 條；並自發布日施行
3.中華民國九十二年四月十日澎湖縣政府府行法字第 0920018601 號令修
  正發布全文 11 條；本規程修正條文自九十二年一月一日施行
4.中華民國九十六年四月十七日澎湖縣政府府行法字第 0961300078 號令
  修正發布名稱及全文 11 條（原名稱：澎湖縣稅捐稽徵處組織規程）
5.中華民國一百年三月二十三日澎湖縣政府府行法字第 1001300190 號令
  修正發布名稱及全文 11 條及編制表；並自中華民國一百年七月一日施
  行（原名稱：澎湖縣政府稅捐稽徵處組織規程）
6.中華民國一百零四年七月六日澎湖縣政府府行法字第 10413024632 號令
  修正發布第3、4、5、11條及編制表；並自中華民國一百零四年八月一日施
  行
7.中華民國一百零四年十月六日澎湖縣政府府行法字第 10413038232 號令
  修正發布編制表；並自中華民國一百零五年一月一日施行
8.中華民國107年7月25日澎湖縣政府府行法字第 1071303193 號令修正發布編制表；並自中華民國一百零七年七月十六日施行